窑沟乡万家在村行政区划上隶属于清水河县，清水河县隶属于呼和浩特市，呼和浩特市隶属于内蒙古自治区，窑沟乡万家在村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。