窑沟乡碓九也村行政区划上隶属于内蒙古自治区呼和浩特市清水河县，窑沟乡碓九也村的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区呼和浩特市清水河县。