红旗镇行政区划上隶属于太仆寺旗，太仆寺旗隶属于锡林郭勒盟，锡林郭勒盟隶属于内蒙古自治区，红旗镇的下属街道自然村居委会及其地理管辖范围内的企业事业单位也属于内蒙古自治区。